Mengacu kepada Peraturan Menteri Dalam Negeri No.13 tahun 2006, tentang Pedoman Pengelolaan Keuangan Daerah, maka berdasarkan kategori Fungsi,   Kesehatan memiliki program dan kegiatan sebagai berikut :

1.  Program Obat dan Perbekalan Kesehatan

1.      Pengadaan obat dan perbekalan kesehatan

2.      Peningkatan pemerataan obat dan pebekalan kesehatan

3.      Peningkatan keterjangkauan harga obat dan perbekalan kesehatan terutama penduduk miskin

4.      Peningkatan mutu pelayanan farmasi komunitas dan rumah sakit

5.      Peningkatan mutu penggunaan obat dan perbekalan kesehatan

6.      Monitoring, evaluasi dan pelaporan

2.  Program Upaya Kesehatan Masyarakat

1.      Pelayanan kesehatan penduduk miskin di puskesmas dan jaringannya

2.      Pemeliharaan dan pemulihan kesehatan

3.      Pengadaan, peningkatan dan perbaikan sarana dan prasarana puskesmas dan jaringannya

4.      Penyelenggaraan pencegahan dan pemberantasan penyakit menular dan wabah

5.      Perbaikan gizi masyarakat

6.      Revitalisasi sistem kesehatan

7.      Pelayanan kefarmasian dan alat kesehatan

8.      Penggandaan peralatan dan perbekalan kesehatan termasuk obat generik esensial

9.      Peningkatan kesehatan masyarakat.

10.  Peningkatan pelayanan kesehatan bagi pengungsi korban bencana

11.  Peningkatan pelayanan dan penanggulangan masalah kesehatan

12.  Penyediaan biaya operasional dan pemeliharaan

13.  Penyelenggaraan penyehatan lingkungan

14.  Monitoring, evaluasi dan pelaporan.

3.  Program Pengawasan Obat dan Makanan

1.      Peningkatan pemberdayaan konsumen/masyarakat di bidang obat makanan

2.      Peningkatan pengawasan keamanan pangan dan bahan berbahaya

3.      Peningkatan kapasitas laboratorium pengawasan obat dan makanan

4.      Peningkatan penyelidikan dan penegakan hukum di bidang obat dan makanan

5.      Monitoring, evaluasi dan pelaporan

4.  Program Pengembangan Obat Asli Indonesia

1.      Fasilitas pengembangan dan penelitian teknologi produksi tanaman obat

2.      Pengembangan standarisasi tanaman obat bahan alam Indonesia

3.      Peningkatan promosi obat bahan alam Indonesia di dalam dan di luar negeri

4.      Pengembangan sistem dan layanan informasi terpadu

5.      Peningkatan kerjasama antar lembaga penelitian dan industri terkait

6.      Monitoring, evaluasi dan pelaporan

5.  Program Promosi Kesehatan dan Pemberdayaan Masyarakat

1.      Pengembangan media promosi dan informasi sadar hidup sehat

2.      Penyuluhan masyarakat pola hidup sehat

3.      Peningkatan pemanfaatan sarana kesehatan

4.      Peningkatan pendidikan tenaga penyuluh kesehatan

5.      Monitoring, evaluasi dan pelaporan

6.  Program Perbaikan Gizi Masyarakat

1.       Penyusunan peta informasi masyarakat kuran gizi

2.       Pemberian tambahan makanan dan vitamin

3.      Penanggulangan Kurang Gizi Protein (KEP), Anemia Gizi Besi, Gangguan Akibat Kurang Yodium (GAKY), Kurang Vitamin A, dan Kekurangan Zat Gizi Mikro lainnya.

4.      Pemberdayaan masyarakat untuk pencapaian keluarga sadar gizi

5.      Penanggulangan Gizi Lebih

6.      Monitoring, evaluasi dan pelaporan.

7. Program Pengembangan Lingkungan Sehat

1.      Pengkajian pengembangan lingkungan sehat

2.      Penyuluhan menciptakan lingkungan sehat

3.      Sosialisasi kebijakan lingkungan sehat

4.      Monitoring, evaluasi dan pelaporan

8.  Program Pencegahan dan Penanggulangan Penyakit Menular

1.      Penyemprotan/fogging sarang nyamuk

2.      Pengadaan alat fogging dan bahan-bahan fogging

3.      Pengadaan vaksin penyakit menular

4.      Pelayanan vaksinasi bagi balita dan anak sekolah

5.      Pelayanan pencegahan dan penanggulangan penyakit menular

6.      Pencegahan  penularan penyakit endemik/epidemik

7.      Pemusnahan/karantina sumber penyebab penyakit menular

8.      Peningkatan imuunisasi

9.      Peningkatan surveilans epidemiologi dan penanggulangan wabah

10.  Peningkatan komunikasi, informasi dan edukasi (KIE) pencegahan dan pemberantasan penyakit

11.  Monitoring, evaluasi dan pelaporan

9.  Program Standarisasi Pelayanan Kesehatan

1.      Penyusunan standar pelayanan kesehatan

2.      Evaluasi dan pengembangan standar pelayanan kesehatan

3.      Pembangunan dan pemutakhiran data dasar standar pelayanan kesehatan

4.      Penyusunan naskah akademis standar pelayanan kesehatan

5.      Penyusunan standar analisis belanja pelayanan kesehatan

6.      Monitoring, evaluasi dan pelaporan

10.  Program Pelayanan Penduduk Miskin

1.      Pelayanan operasi katarak

2.      Pelayanan kesehatan THT

3.      Pelayanan operasi bibir sumbing

4.      Pelayanan sunatan massal

5.      Penanggulangan ISPA

6.      Penanggulangan penyakit cacingan

7.      Pelayanan kesehatan kulit dan kelamin

8.      Pelayanan kesehatan akibat gizi buruk/busung lapar

9.      Pelayanan kesehatan akibat lumpuh layu

10.  Monitorig, evaluasi dan pelaporan

11.  Program Pengadaan, Peningkatan dan Perbaikan Sarana dan Prasarana Puskesmas/Puskesmas Pembantu dan Jaringannya

1.      Pembangunan puskesma

2.      Pembangunan puskesmas pembantu

3.      Pengadaan puskesmas perairan

4.      Pengadaan puskesmas keliling

5.      Pembangunan posyandu

6.      Pengadaan sarana dan prasarana puskesmas

7.      Pengadaan sarana dan prasarana puskesmas pembantu

8.      Pengadaan sarana dan prasarana puskesmas perairan

9.      Pengadaan sarana dan prasarana puskesmas keliling

10.  Pengadaan sarana dan prasarana posyandu

11.  Peningkatan puskesmas menjadi puskesmas rawat inap

12.  Peningkatan puskesmas pembantu menjadi puskesmas

13.  Pemeliharaan rutin/berkala sarana dan prasarana puskesmas

14.  Pemeliharaan rutin/berkala sarana dan prasarana puskesmas pembantu

15.  Pemeliharaan rutin/berkala sarana dan prasarana puskesmas perairan

16.  Pemeliharaan rutin/berkala sarana dan prasarana puskesmas keliling

17.  Pemeliharaan rutin/berkala sarana dan prasarana posyandu

18.  Rehabilitasi sedang/berat puskesmas pembantu

19.  Rehabilitasi sedang/berat puskesmas perairan

20.  Monitoring, evaluasi dan pelaporan

12.  Program kemitraan peningkatan pelayanan kesehatan

1.      Kemitraaan asuransi kesehatan masyarakat

2.      Kemitraan pencegahan dan pemberantasan penyakit menular

3.      Kemitraan pengolahan limbah rumah sakit

4.      Kemitraan alih teknologi kedokteran dan kesehatan

5.      Kemitraan peningkatan kualitas dokter dan paramedis

6.      Kemitraan pengobatan lanjutan bagi pasien rujukan

7.      Kemitraan pengobatan bagi pasien yang kurang mampu

8.      Monitoring, evaluasi dan pelaporan

13. Program peningkatan pelayanan kesehatan anak balita

1.      Penyuluhan kesehatan anak balita

2.      Immunisasi bagi anak balita

3.      Rekrutmen tenaga pelayanan kesehatan anak balita

4.      Pelatihan dan pendidikan perawatan anak balita

5.      Pembangunan sarana dan prasarana khusus pelayanan perawatan anak balita

6.      Pembangunan panti asuhan anak terlantar balita

7.      Monitoring, evaluasi dan pelaporan

14. Program peningkatan pelayanan kesehatan lansia

1.      Pelayanan pemeliharaan Kesehatan

2.      Rekruitmen tenaga perawat Kesehatan

3.      Pendidikan dan pelatihan perawatan kesehatan

4.      Pembangunan pusat-pusat pelayanan kesehatan

5.      Pembangunan panti asuhan

6.      Pelayanan kesehatan

7.      Monitoring, evaluasi dan pelaporan

15. Program pengawasan dan pengendalian kesehatan makanan

1.      Pengawasan keamanan dan kesehatan makanan hasil industri

2.      Pengawasan dan pengendalian keamanan dan kesehatan makanan hasil produksi rumah tangga

3.      Pengawasan dan pengendaliankeamanan dan kesehatan makanan restaurant

4.      Monitoring, evaluasi dan pelaporan

16. Program peningkatan keselamatan ibu melahirkan dan anak

1.      Penyuluhan kesehatan bagi ibu hamil  keluarga kurang mampu

2.      Perawatan secara berkala bagi ibu hamil bagi keluarga kurang mampu

3.  Pertolongan persalinan bagi ibu dari keluarga kurang mampu.